Знаймо

Додати знання

приховати рекламу

Цей текст може містити помилки.

Нуклеотиди



План:


Введення

Нуклеотиди - фосфорні ефіри нуклеозидів, нуклеозідфосфати. Вільні нуклеотиди, зокрема АТФ, цАМФ, АДФ, грають важливу роль в енергетичних і інформаційних внутріклітинних процесах, а також є складовими частинами нуклеїнових кислот і багатьох коферментів.


1. Будова

Нуклеотиди є складними ефірами нуклеозидів і фосфорних кислот. Нуклеозиди, в свою чергу, є N- глікозидами, що містять гетероциклический фрагмент, пов'язаний через атом азоту з C-1 атомом залишку цукру.

Будова нуклеотидів

У природі найбільш поширені нуклеотиди, які є β-N-глікозидами пуринів або піримідинів і пентоз - D-рибози або D-2-рибози. В залежності від структури пентози розрізняють рибонуклеотиди і дезоксірібонуклеотіди, які є мономерами молекул складних біологічних полімерів (полінуклеотидів) - відповідно РНК або ДНК. [1]

Фосфатний залишок у нуклеотидах зазвичай утворює складноефірний зв'язок з 2'-, 3'-або 5'-гідроксильними групами рибонуклеозид, в разі 2'-дезоксинуклеозидов етеріфіціруются 3'-або 5'-гідроксильні групи.

Більшість нуклеотидів є моноефірамі ортофосфорної кислоти, проте відомі і діефіри нуклеотидів, в яких етерифіковані два гідроксильних залишку - наприклад, циклічні нуклеотиди ціклоаденін-і ціклогуанін монофосфату ( цАМФ і цГМФ). Поряд з нуклеотидами - ефірами ортофосфорної кислоти (монофосфату) в природі також поширені і моно-і діефіри пірофосфорної кислоти (дифосфати, наприклад, аденозиндифосфат) і моноефіри тріполіфосфорной кислоти (трифосфати, наприклад, аденозинтрифосфат).


2. Номенклатура

Літерні коди для позначення нуклеотидів
Код Означає Комплементарна пара
A A T в ДНК;
U в РНК
C C G
G G C
T
або U
T в ДНК;
U в РНК
A
M A
або C
K
R A
або G
Y
W A
або T
W
S C
або G
S
Y C
або T
R
K G
або T
M
V A
або C
або G
B
H A
або C
або T
D
D A
або G
або T
H
B C
або G
або T
V
X
або N
A
або C
або G
або T (U)
будь

Сполуки, що складаються з двох нуклеотідових молекул, називаються динуклеотид, з трьох - трінуклеотідамі, з невеликого числа - олігонуклеотиди, а з багатьох - полинуклеотидами, або нуклеїновими кислотами.

Назви нуклеотидів є абревіатури у вигляді стандартних трьох-або чотирибуквені кодів.

Якщо абревіатура починається з малої літери "д" ( англ. d ), Значить мається на увазі дезоксірібонуклеотіди; відсутність літери "д" означає рибонуклеотид. Якщо абревіатура починається з малої букви "ц" ( англ. c ), Значить мова йде про циклічної формі нуклеотиду (наприклад, цАМФ).

Перша велика буква абревіатури вказує на конкретне азотистих основ або групу можливих нуклеїнових підстав, друга буква - на кількість залишків фосфорної кислоти в структурі (М - моно-, Д - ді-, Т - три-), а третя прописна буква - завжди буква Ф ("- фосфат "; англ. P ).

Латинські і російські коди для нуклеїнових підстав:

Загальноприйняті буквені коди для позначення нуклеотидних підстав відповідають номенклатурі, прийнятої Міжнародним товариством теоретичної та прикладної хімії (International Union of Pure and Applied Chemistry, скорочено - англ. IUPAC , рус. ІЮПАК ) І Міжнародним товариством біохімії та молекулярної біології (International Union of Biochemistry and Molecular Biology, скорочено - англ. IUBMB ). Якщо при секвенування послідовності ДНК або РНК виникає сумнів у точності визначення того або іншого нуклеотиду, крім п'яти основних (A, C, T, G, U), використовують інші букви латинського алфавіту в залежності від того, які найбільш ймовірні нуклеотиди можуть перебувати в даній позиції послідовності.

Довжину секвенувати ділянок ДНК ( гена, сайту, хромосоми) або всього генома вказують в парах нуклеотидів (пн), або парах основ ( англ. base pairs , Скорочено bp), маючи на увазі елементарну одиницю двухцепочечной молекули нуклеїнової кислоти, складену з двох спарених комплементарних підстав.


3. Виступають в ролі коферментів (ФАД, ФМН, НАД +, НАДФ +)

4. Циклічні мононуклеотиди є вторинними посередниками при дії гормонів та інших сигналів (цАМФ, цГМФ).

5. Аллостерічеськіє регулятори активності ферментів.

6. Є мономерами в складі нуклеїнових кислот, пов'язані 3'-5'- фосфодіефірнимі зв'язками.


3. Історія

В домолекулярной генетиці для позначення найменшого елемента в структурі ДНК, який може бути підданий спонтанної або індукованої мутації, застосовувався особливий термін рекон. В даний час показано, що таким найменшим елементом є один нуклеотид (або одне азотистих основ у складі нуклеотиду), тому цей термін більше не вживається. Для визначення поняття одиниця мутації застосовувався термін мутон. В даний час показано, що фенотипічно мутація може проявитися навіть при заміні одного нуклеотиду (або азотистого підстави у складі нуклеотиду), таким чином, термін мутон відповідає одному нуклеотиду.


Примітки

  1. Abbreviations and Symbols for Nucleic Acids, Polynucleotides and their Constituents - www.chem.qmul.ac.uk / iupac / misc / naabb.html IUPAC-IUB Commission on Biochemical Nomenclature (CBN) Accessed 03 Jan 2006

Цей текст може містити помилки.

Схожі роботи | скачати
© Усі права захищені
написати до нас
Рейтинг@Mail.ru